據美國化學學會C&EN統計，2005年第三季度美國生物制藥行業總體形勢發展良好，大型企業發展勢頭迅猛，安進（Amgen）、基因技術公司（Genentech）、吉利德公司（Gilead Sciences）、雪蘭諾公司（Serono）與諾和諾德公司等（Novo Nordisk）等都有不俗表現，但多數小型企業出現虧損，并有6家企業出現銷售收入下降。

其中，基因技術公司的營業收入雖低于安進，但已是本年度至今取得的最佳業績，增長45.7%，達18億美元，利潤漲幅高達47.8%，達3.84億美元。醫師將其產品應用于未經批準的適應證與銷售額的增長密切相關，但公司方面聲稱其銷售團隊未進行相關推廣。例如，將一線轉移性腸癌治療用藥單克隆抗體bevacizumab（Avastin）用于其他癌癥的治療，使美國市場第三季度銷售額與去年同期增長了近78%，達3.25億美元。與此相類似的還有群司珠單抗（trastuzumab，赫賽汀，Herceptin），其銷售額增長率也高達70%，為2.15億美元，用于未經批準的乳腺癌輔助治療對其銷售額的貢獻不可忽視。

安進公司雖然被基因技術公司快速增長的光芒所掩蓋，但事實上其表現亦可圈可點，利潤增長27.2%，達11億美元，收入增長16.3%，達32億美元。貧血治療藥darbepoetin alfa（Aranesp）的銷售額持續增長，實現銷售8.4億美元，增長38%。與惠氏公司（Wyeth）合作上市推出的銀屑病與關節炎治療藥物依那西普（etanercept，Enbrel）增長35%，達6.68億美元。中性粒細胞減少癥治療藥聚乙二醇化非格司亭（PEG-filgrastim，Neulasta）與非格司亭（filgrastim，Neupogen）的總銷售額也上升了17%，達到8.82億美元。

相比之下，美國第三大生物技術公司生物基因公司（Biogen Idec）的處境則略為艱難，雖實現收入增長9.7%，共計5.96億美元，但利潤減少7.3%，共1.22億美元。多發性硬化癥治療藥物β-1α干擾素（interferon beta-1a ，Avonex）是拉動銷售增長的主要力量，第三季度增長8%，共完成銷售3.75億美元。另一個主要產品為非霍奇金淋巴瘤治療藥物利妥昔單抗（rituximab，美羅華，Rituxan），在美國市場由生物基因公司與基因技術公司共同推廣銷售。此外，公司首席執行官（CEO）James C. Mullen稱該在第三季度初公司執行了1項計劃，即在裁員17%的同時加強與外部開發機構的合作，目前，正在與蛋白質設計試驗室（Protein Design Labs）協作開發3個處于Ⅱ期臨床研究的抗體藥物。同時，生物基因公司將繼續與Elan公司合作爭取使多發性硬化癥治療藥那他珠單抗（natalizumab，Tysabri）重返美國與歐洲市場。由于在臨床研究中出現意外死亡病例，2005年3月該藥物撤出美歐市場。

瑞士生物技術公司雪蘭諾公司（Serono）與生物基因公司有2點相似之處：即公司銷售對單個多發性硬化癥治療藥物的高度依賴及其平淡無奇的第三季度表現。雪蘭諾實現利潤1.59億美元，增長32.7%。但收入僅微增0.7%，共計6.38億美元。其中，多發性硬化癥治療藥β-1α干擾素（interferon beta-1a，Rebif）的銷售額占總銷售收入的55%。與生物基因公司一樣，雪蘭諾公司積極參與公司間合作，第三季度，雪蘭諾公司與Rigel Pharmaceuticals簽署授權協議，雪蘭諾取得Rigel的Aurora蛋白質激酶抑制劑獨家授權用于開發及展開商業化行銷，授權涵蓋日本以外的全世界，而雪蘭諾在未來兩年還有納入日本的選擇權利。近期，雪蘭諾公司采取了另一重大舉措是聘請高盛集團為其評估多種戰略方案，盡管公司拒絕給出進一步的信息，但市場預測公司高層可能考慮出售雪蘭諾。

第三季度生物技術行業最盈利的公司非吉利德公司（Gilead Sciences）莫屬。與其他生物技術公司不同，吉利德主要經營小分子藥物，第三季度公布銷售額4.94億美元，增長51.3%。利潤1.76億美元，增長58.3%，利潤率高達36.3%。抗HIV產品為吉利德公司的強項，第三季度共計銷售3.64億美元，增長59%。暢銷藥物為Truvada，本品為恩曲他濱（emtricitabine）與替諾福韋酯（tenofovir disoproxil fumarate）的復方片劑，單方藥物替諾福韋酯（tenofovir disoproxil fumarate，Viread）與恩曲他濱（emtricitabine，Emtriva）的銷售額則隨之下降。此外，本季度值得一提的事件為吉利德公司向恩曲他濱發現方美國Emory大學支付了5.25億美元的歷史性高價，以購買恩曲他濱的使用權。

疫苗生產企業有喜有憂，凱龍疫苗公司（Chiron）銷售收入下跌9.4%，至4.8億美元，利潤上漲38.9%，至7290萬美。在上個流感季節里，凱龍公司設在英國利物浦的疫苗生產企業因為在消毒方面出現了問題，而被迫停止生產流感疫苗。2005年第三季度，公司設在德國的一家疫苗生產企業又出現了類似問題。第四季度初，凱龍公司從美國衛生與公眾服務部獲得了1份6250萬美元的禽流感開發合同值得關注。更令人矚目的是凱龍公司同意接受諾華（Novartis）的收購。諾華將出資51億美元收購凱龍公司所有剩余的58%股份。諾華公司宣稱在完成收購后，凱龍將生產出更多更高質量的疫苗產品。

醫學免疫公司（MedImmune）公布的數據顯示，2005年第三季度實現收入1.54億美元，獲利65.7%，但虧損6080萬美元。該公司的主要產品為用來預防新生兒呼吸道感染的單克隆抗體類藥物帕利珠單抗（palivizumab，Synagis），全球共實現銷售1.01億美元，增長66%。醫學免疫公司在禽流感疫苗市場有其獨到之處，它擁有鼻噴霧流感疫苗（FluMist），實現銷售1000萬美元。若與國家衛生部門合作開發禽流感疫苗成功，醫學免疫公司將發展成為更大規模并更具實力的生物制藥企業。

Nabi公司報告實現銷售收入3080萬美元，下降29.7%，虧損1610萬美元。與去年同期相比，它的乙酸鈣（calcium acetate）磷結合劑與用于肝臟移植手術的乙型肝炎免疫球蛋白（Nabi-HB）的銷售額皆有所下降。

第四季度初，Nabi報告了1種用于防止金黃色葡萄球菌感染的疫苗StaphVax的Ⅲ期臨床研究結果，由于對參與研究的血液透析患者無法達到預計的治療目的，公司已經停止了該藥物的開發，同時將對實驗結果進行進一步評估